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破解"生物奥秘",曙光中标中科院动物所!

中科曙光 2022-07-03


一只蚂蚱有多可怕?在草丛里蹦蹦跳跳的小虫一天就能吃掉3.5万人的口粮;1924年的一次蝗灾甚至导致南京铁路的一辆火车都无法开动。

 

人们百思不得其解,往往将这类“生物事件”归结为“天灾”。但中科院动物研究所偏偏不信这个“邪”,经过20多年的钻研,找到了蝗虫成灾的奥秘,并且,今年8月12日,《自然》(Nature)杂志发表了这一成果。


 

曙光携手中科院动物所,助力破解“生物奥秘”

 

该成果的背后,是大量的生物基因数据分析工作,其中涌现出庞大的计算需求。近日,曙光中标中科院动物研究所,为其提供先进计算集群系统,助力动物所针对虫害鼠成灾与控制问题展开生物基因研究,破解更多“生物奥秘”。

 

此次刊登在《自然》杂志的研究成果,首次从化学分析、行为验证、神经电生理记录等多个层面对飞蝗群居信息素进行了全面鉴定和验证,发现和确立了4VA是飞蝗群聚信息素,而过去报道已知的其它化合物都不具备群聚信息素的所有条件,本项研究范式将化学生态学的研究提高到一个新的阶段。

 

就昆虫学科来说,将越来越趋向于从分子水平研究生物事件,并探讨其功能机制。基于曙光先进计算平台,动物所将开展大量的理论研究工作,为害虫免疫控制及昆虫源抗微生物药物的挖掘与研究提供有力支持。

 

曙光先进计算集群系统将支撑动物所,围绕重大害虫害鼠成灾与控制的关键科学问题,揭示其种群的时间、空间和遗传动态,以及阐明其对环境胁迫因子的适应性对策,发现害虫害鼠与植物和天敌协同进化的新模式,建立全球变化环境下生态管理的理论与技术体系,从而发展“绿色控制”新途径。

 

破解数据分析瓶颈,强大计算资源助力生物研究


单个文件大、覆盖面广、测序深度深,是基因组学数据的基本特征。解决现有的海量昆虫基因组学数据,以及昆虫生态学大文件的存储问题尤为重要。


另外,数量巨大的小文件传输,将产生的I/O负载瓶颈。在数据分析过程中,无论是基因组学还是生态学都需要处理巨量的小文件,现有资源的I/O负载过高是数据分析的瓶颈之一。

 

此次曙光为动物所搭建先进计算集群系统,提供可达100TFlops强大浮点计算能力。整套仪器包含胖节点,刀片计算节点,登录和管理节点,存储IO节点,存储阵列,交换机,并行文件系统,作业调度系统以及整体机柜。为动物所提供强大的算力支撑,助力其开展重大害虫害鼠成灾与控制的相关研究。

 

曙光先进计算系统在生物基因研究领域,拥有众多成功部署案例。同时,基于曙光先进计算平台,催生了大量科研成果。未来,曙光致力于为更多科研机构以及企业提供先进计算系统支持,促进科技进步,支撑产业发展。



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